第1集 1937年“卢沟桥事变”爆发后，原国民政府国防部中校参谋、中共地下党员欧阳剑平，前来与地下党冯先生接头。冯先生让欧阳剑平在上海组织一支秘密的特工组，与日特间谍机关展开斗争。几天后，欧阳剑平在码头迎接密码专家高寒。曾任国民政府驻东京领事馆武官的马云飞也正在回上海的火车上，并邂逅上海日军宪兵司令部特高课的课长酒井美惠子。当晚，他们去等候小组另一成员———爆破专家李智博时，意外地与酒井再次相遇，她的手枪直抵马云飞的脑袋！
第2集 情况紧急，欧阳剑平安排高寒用“摩尔斯”密码指法通知了落入敌手的马云飞，使其成功逃脱。正当他们为此庆幸之际，李智博又落入了日特的手中。面对这种情况，欧阳剑平想到了江湖上人称“百变神偷”的何坚。酒井要女间谍竹内云子引诱汪精卫的机要秘书黄浚和他的儿子，搜集军事情报。当夜，马云飞和何坚成功地将李智博救出。但在何坚从保险箱盗取密码机时，引起了敌人的注意，马云飞开枪吸引敌人……
第3集 马云飞落到了酒井手里。酒井决定处死马云飞，何坚从水底解开了马云飞的绳索……至此，五号特工组的成员全部到位。竹内云子化名廖雅权，在国防部招待所打工。蒋介石下令封锁长江江阴要塞，情报很快就到了竹内云子手中。酒井通知日本舰船逃离至公海，被高寒破译。于是，欧阳剑平和马云飞星夜兼程赶往南京。
第4集 欧阳剑平意识到，南京政府的高层出了问题。马云飞在招待所注意到廖雅权经常拿着一顶紫色的礼帽很不合时宜。竹内云子也意识到这个陌生客人的危险，动了杀机。几天后，蒋介石决定到上海前线督战，又险些遭到日军的谋杀。
第5集 五号特工组秘密跟踪，拍下廖雅权、黄浚和日本大使在玄武湖接头时的情景，可马云飞却意外暴露了！为了掌握进一步的证据，欧阳剑平故意让戴笠放出假情报，何坚则调换了黄浚交换情报的那顶紫色礼帽。证据确凿，三个地点同时展开了对竹内云子、黄浚、黄晟的抓捕行动！
第6集 酒井营救出即将被判死刑的竹内云子并转移到了上海，秘密隐居在法租界。通过日本友人中西平的关系，特工组掌握了竹内云子一个生活习惯，就是她爱喝“圣代牌”咖啡。终于，高寒发现了一个小保姆要买那种牌子的咖啡……
第7集 特工组在女特工被转移的前一刻将她击毙。“南京大屠杀”发生了，日军为了掩盖暴行，将当时在南京的一批外国记者秘密押送到了上海，实行了软禁。国防部参谋王铁生将这一重要情报送给了冯先生，要求尽快找到一名叫约瑟夫的奥地利记者。约瑟夫被救出并潜回南京，想拿回自己拍下记录日军暴行的胶卷，敌人却提前设了防。
第8集 终于，日军的暴行在全世界曝光了。此时，汪精卫公开投敌。为了弄清真相，马云飞通过中西平做了解，在接头地点却突遇酒井突击检查……马云飞的生日，居然有人送来蛋糕。两件事使马云飞想到了多年没有来往的父亲……
第9集 戴笠派老于来上海和汪精卫集团的傅仁宗联系，希望取得内应，刺杀汪精卫，傅仁宗暗中将老于出卖。傅仁宗手里有一份杀害进步人士的黑名单，根据指示欧阳剑平要拿到这份名单，并伺机将傅仁宗除掉。
第10集 马云飞假扮成理发师到了傅家，却意外地遇见了齐冠雄。马云飞虽机智脱险，但任务却没有完成。傅仁宗更加谨慎了，但几天后他得病了。欧阳剑平让高寒化装成打针的护士，由李智博同行。可就在门口，傅家的警卫却将李智博拦在了门外！
第11集 高寒独闯虎穴，机智地拿到“黑名单”，并除掉了傅仁宗。一天，高寒破译了一份来自柏林德军司令部的密电，说有一个叫格尔的上校要来上海。很快，他们打听到了格尔此行是要寻找一个叫托马斯的犹太人。此人是一个研究重水的专家，德军寻找他是为了研究原子武器。信息也被酒井掌握了。
第12集 酒井借故对上海的犹太人定居点进行全面的清查，何坚机智地将敌人调开，并将托马斯藏在粪车内运出了犹太人定居点，不料被便衣发现。托马斯落入敌人手里，李智博决定先将敌人稳住……
第13集 李智博让玛尔娜教授去医院探视托马斯，并随口说出他的真实身份。酒井中计，计划在格尔押送托马斯去机场的路上，将其截住。五号特工组提前设伏，再次将托马斯营救出来。五号特工组将托马斯秘密送往重庆，却被酒井的便衣发现了迹象，托马斯再次被抓走。格尔命令，连夜将托马斯押送机场！
第14集 敌人的阴谋就要得逞，马云飞含泪将其射死，托马斯的脸上却露出了微笑。原来，这是托马斯“最后的请求”。新四军需要药品，叶挺将军亲自派人来上海找冯先生。马云飞登门求助经营药品的肖老板，却遭谢绝。但一个电话使马云飞得知，肖老板正和齐冠雄暗地里做药品生意，发国难财。于是，他们决定抓住这个机会……
第15集 趁齐冠雄与肖老板签订合同之际，五号特工组闯入，要挟齐冠雄将这批药品护送出吴淞口。齐冠雄狡猾地耍了花招，致使药品落入了日特机关手中。酒井让齐冠雄引五号特工组上钩，消息被卧底的阿强偷听到。马云飞重新将药品夺回，并将计就计地利用齐冠雄闯过了检查关口，准备空运。
第16集 药品被空投到了皖南新四军的营地……几个月后，老于再次来到上海，他希望五号特工组替他盗取日军第二次长沙会战作战计划，因为日军师团长渡边将军要来上海养病。渡边随从森村副官将装有作战计划的公文包铐在手上，要得到几乎是不可能的……（待续）
看点：该剧是一部以真实史料为背景的抗日间谍片，全剧主要描写了中共地下党员欧阳剑平与4位身怀绝技的青年志士，秘密组成“五号”特工组，与日军宪兵司令部间谍机关特高课、汪伪特工机构“76号”斗智斗勇的故事。
